RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628364.2

NRXN1-228, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 2,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-228ENST00000628364 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.88■■■■■ 6.7
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NRXN1-228ENST00000628364 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.76■■■■■ 5.24
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NRXN1-228ENST00000628364 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
NRXN1-228ENST00000628364 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.76■■■■■ 5.08
NRXN1-228ENST00000628364 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.76■■■■■ 4.92
NRXN1-228ENST00000628364 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.55■■■■■ 4.88
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NRXN1-228ENST00000628364 SCRIBQ14160 1630 aa45.2■■■■■ 4.83
NRXN1-228ENST00000628364 NACADO15069 1562 aa45.07■■■■■ 4.8
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NRXN1-228ENST00000628364 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.4■■■■■ 4.7
NRXN1-228ENST00000628364 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.15■■■■■ 4.66
NRXN1-228ENST00000628364 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.05■■■■■ 4.64
NRXN1-228ENST00000628364 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.96■■■■■ 4.63
NRXN1-228ENST00000628364 TRIM41Q8WV44 630 aa43.82■■■■■ 4.61
NRXN1-228ENST00000628364 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
NRXN1-228ENST00000628364 WIZO95785 1651 aa43.78■■■■■ 4.6
NRXN1-228ENST00000628364 HRCP23327 699 aa43.68■■■■■ 4.58
NRXN1-228ENST00000628364 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.68■■■■■ 4.58
NRXN1-228ENST00000628364 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.47■■■■■ 4.55
NRXN1-228ENST00000628364 SMARCA4P51532 1647 aa43.36■■■■■ 4.53
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NRXN1-228ENST00000628364 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
NRXN1-228ENST00000628364 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
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NRXN1-228ENST00000628364 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.98■■■■■ 4.47
NRXN1-228ENST00000628364 SMARCA2P51531 1590 aa42.97■■■■■ 4.47
NRXN1-228ENST00000628364 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.75■■■■■ 4.43
NRXN1-228ENST00000628364 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.71■■■■■ 4.43
NRXN1-228ENST00000628364 ABCC8Q09428 1581 aa42.61■■■■■ 4.41
NRXN1-228ENST00000628364 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.55■■■■■ 4.4
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NRXN1-228ENST00000628364 EEA1Q15075 1411 aa42.33■■■■■ 4.37
NRXN1-228ENST00000628364 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
NRXN1-228ENST00000628364 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.3■■■■■ 4.36
NRXN1-228ENST00000628364 SOGA1O94964 1423 aa42.18■■■■■ 4.34
NRXN1-228ENST00000628364 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
NRXN1-228ENST00000628364 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.13■■■■■ 4.34
NRXN1-228ENST00000628364 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.07■■■■■ 4.32
NRXN1-228ENST00000628364 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.06■■■■■ 4.32
NRXN1-228ENST00000628364 CEP162Q5TB80 1403 aa41.96■■■■■ 4.31
NRXN1-228ENST00000628364 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.92■■■■■ 4.3
NRXN1-228ENST00000628364 GOLGA3Q08378 1498 aa41.85■■■■■ 4.29
NRXN1-228ENST00000628364 SYNJ1O43426 1573 aa41.85■■■■■ 4.29
NRXN1-228ENST00000628364 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
NRXN1-228ENST00000628364 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.68■■■■■ 4.26
NRXN1-228ENST00000628364 KIF21BO75037 1637 aa41.66■■■■■ 4.26
NRXN1-228ENST00000628364 HMGXB3Q12766 1538 aa41.65■■■■■ 4.26
NRXN1-228ENST00000628364 NCAPD3P42695 1498 aa41.64■■■■■ 4.26
NRXN1-228ENST00000628364 TOP2BQ02880 1626 aa41.53■■■■■ 4.24
NRXN1-228ENST00000628364 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.42■■■■■ 4.22
NRXN1-228ENST00000628364 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
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NRXN1-228ENST00000628364 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
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NRXN1-228ENST00000628364 CFTRP13569 1480 aa41.18■■■■■ 4.18
NRXN1-228ENST00000628364 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
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NRXN1-228ENST00000628364 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.09■■■■■ 4.17
NRXN1-228ENST00000628364 CUX1P39880 1505 aa41.07■■■■■ 4.16
NRXN1-228ENST00000628364 PRXQ9BXM0 1461 aa41.02■■■■■ 4.16
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NRXN1-228ENST00000628364 PRDM2Q13029 1718 aa40.92■■■■■ 4.14
NRXN1-228ENST00000628364 APLP2Q06481 763 aa40.89■■■■■ 4.14
NRXN1-228ENST00000628364 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.74■■■■■ 4.11
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NRXN1-228ENST00000628364 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.56■■■■■ 4.08
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NRXN1-228ENST00000628364 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.39■■■■■ 4.06
NRXN1-228ENST00000628364 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.34■■■■■ 4.05
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NRXN1-228ENST00000628364 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.29■■■■■ 4.04
NRXN1-228ENST00000628364 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.25■■■■■ 4.03
NRXN1-228ENST00000628364 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
NRXN1-228ENST00000628364 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
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NRXN1-228ENST00000628364 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
NRXN1-228ENST00000628364 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.1■■■■■ 4.01
NRXN1-228ENST00000628364 MAP3K1Q13233 1512 aa40.07■■■■■ 4
NRXN1-228ENST00000628364 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.04■■■■■ 4
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NRXN1-228ENST00000628364 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
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NRXN1-228ENST00000628364 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.92■■■■□ 3.98
NRXN1-228ENST00000628364 TIAM1Q13009 1591 aa39.92■■■■□ 3.98
NRXN1-228ENST00000628364 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.9■■■■□ 3.98
NRXN1-228ENST00000628364 NESP48681 1621 aa39.9■■■■□ 3.98
NRXN1-228ENST00000628364 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.89■■■■□ 3.98
NRXN1-228ENST00000628364 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
NRXN1-228ENST00000628364 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
NRXN1-228ENST00000628364 CUL7Q14999 1698 aa39.85■■■■□ 3.97
NRXN1-228ENST00000628364 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
NRXN1-228ENST00000628364 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
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