RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379378.7

E2F4-201, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene E2F4, Length 2,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-201ENST00000379378 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.18■■■■■ 7.22
E2F4-201ENST00000379378 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.93■■■■■ 5.9
E2F4-201ENST00000379378 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.75■■■■■ 5.71
E2F4-201ENST00000379378 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.96■■■■■ 5.59
E2F4-201ENST00000379378 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.64■■■■■ 5.54
E2F4-201ENST00000379378 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.58■■■■■ 5.53
E2F4-201ENST00000379378 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.68■■■■■ 5.38
E2F4-201ENST00000379378 ABCC9O60706 1549 aa48.55■■■■■ 5.36
E2F4-201ENST00000379378 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
E2F4-201ENST00000379378 NACADO15069 1562 aa48.18■■■■■ 5.3
E2F4-201ENST00000379378 SCRIBQ14160 1630 aa48.1■■■■■ 5.29
E2F4-201ENST00000379378 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.57■■■■■ 5.21
E2F4-201ENST00000379378 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
E2F4-201ENST00000379378 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.83■■■■■ 5.09
E2F4-201ENST00000379378 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.82■■■■■ 5.08
E2F4-201ENST00000379378 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.79■■■■■ 5.08
E2F4-201ENST00000379378 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.62■■■■■ 5.05
E2F4-201ENST00000379378 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.35■■■■■ 5.01
E2F4-201ENST00000379378 WIZO95785 1651 aa46.3■■■■■ 5
E2F4-201ENST00000379378 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.26■■■■■ 5
E2F4-201ENST00000379378 SMARCA4P51532 1647 aa46.09■■■■■ 4.97
E2F4-201ENST00000379378 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.04■■■■■ 4.96
E2F4-201ENST00000379378 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
E2F4-201ENST00000379378 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.41■■■■■ 4.86
E2F4-201ENST00000379378 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
E2F4-201ENST00000379378 TRIM41Q8WV44 630 aa45.4■■■■■ 4.86
E2F4-201ENST00000379378 SMARCA2P51531 1590 aa45.39■■■■■ 4.86
E2F4-201ENST00000379378 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.35■■■■■ 4.85
E2F4-201ENST00000379378 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.16■■■■■ 4.82
E2F4-201ENST00000379378 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.12■■■■■ 4.81
E2F4-201ENST00000379378 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
E2F4-201ENST00000379378 ABCC8Q09428 1581 aa44.77■■■■■ 4.76
E2F4-201ENST00000379378 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
E2F4-201ENST00000379378 NCAPD3P42695 1498 aa44.52■■■■■ 4.72
E2F4-201ENST00000379378 HMGXB3Q12766 1538 aa44.5■■■■■ 4.71
E2F4-201ENST00000379378 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.26■■■■■ 4.68
E2F4-201ENST00000379378 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.18■■■■■ 4.66
E2F4-201ENST00000379378 SOGA1O94964 1423 aa44.11■■■■■ 4.65
E2F4-201ENST00000379378 SYNJ1O43426 1573 aa44.11■■■■■ 4.65
E2F4-201ENST00000379378 PCGF6Q9BYE7 350 aa44■■■■■ 4.63
E2F4-201ENST00000379378 EEA1Q15075 1411 aa43.98■■■■■ 4.63
E2F4-201ENST00000379378 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.93■■■■■ 4.62
E2F4-201ENST00000379378 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.9■■■■■ 4.62
E2F4-201ENST00000379378 CFTRP13569 1480 aa43.81■■■■■ 4.6
E2F4-201ENST00000379378 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.78■■■■■ 4.6
E2F4-201ENST00000379378 TOP2BQ02880 1626 aa43.78■■■■■ 4.6
E2F4-201ENST00000379378 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.7■■■■■ 4.59
E2F4-201ENST00000379378 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
E2F4-201ENST00000379378 PRDM2Q13029 1718 aa43.57■■■■■ 4.57
E2F4-201ENST00000379378 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.55■■■■■ 4.56
E2F4-201ENST00000379378 CUX1P39880 1505 aa43.51■■■■■ 4.56
E2F4-201ENST00000379378 GOLGA3Q08378 1498 aa43.51■■■■■ 4.56
E2F4-201ENST00000379378 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.47■■■■■ 4.55
E2F4-201ENST00000379378 CEP162Q5TB80 1403 aa43.45■■■■■ 4.55
E2F4-201ENST00000379378 KIF21BO75037 1637 aa43.44■■■■■ 4.54
E2F4-201ENST00000379378 HRCP23327 699 aa43.41■■■■■ 4.54
E2F4-201ENST00000379378 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.4■■■■■ 4.54
E2F4-201ENST00000379378 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
E2F4-201ENST00000379378 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.15■■■■■ 4.5
E2F4-201ENST00000379378 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
E2F4-201ENST00000379378 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.03■■■■■ 4.48
E2F4-201ENST00000379378 KIF27Q86VH2 1401 aa43.02■■■■■ 4.48
E2F4-201ENST00000379378 PRXQ9BXM0 1461 aa43■■■■■ 4.47
E2F4-201ENST00000379378 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.96■■■■■ 4.47
E2F4-201ENST00000379378 NESP48681 1621 aa42.95■■■■■ 4.47
E2F4-201ENST00000379378 CLIP1P30622 1438 aa42.89■■■■■ 4.46
E2F4-201ENST00000379378 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.88■■■■■ 4.46
E2F4-201ENST00000379378 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.82■■■■■ 4.45
E2F4-201ENST00000379378 CUX2O14529 1486 aa42.78■■■■■ 4.44
E2F4-201ENST00000379378 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.76■■■■■ 4.44
E2F4-201ENST00000379378 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.75■■■■■ 4.43
E2F4-201ENST00000379378 TOPBP1Q92547 1522 aa42.67■■■■■ 4.42
E2F4-201ENST00000379378 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.62■■■■■ 4.41
E2F4-201ENST00000379378 IGF1RP08069 1367 aa42.61■■■■■ 4.41
E2F4-201ENST00000379378 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
E2F4-201ENST00000379378 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
E2F4-201ENST00000379378 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
E2F4-201ENST00000379378 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.49■■■■■ 4.39
E2F4-201ENST00000379378 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
E2F4-201ENST00000379378 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.48■■■■■ 4.39
E2F4-201ENST00000379378 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.46■■■■■ 4.39
E2F4-201ENST00000379378 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.4■■■■■ 4.38
E2F4-201ENST00000379378 ARAP1Q96P48 1450 aa42.4■■■■■ 4.38
E2F4-201ENST00000379378 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.36■■■■■ 4.37
E2F4-201ENST00000379378 WDR97A6NE52 1622 aa42.26■■■■■ 4.36
E2F4-201ENST00000379378 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
E2F4-201ENST00000379378 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.22■■■■■ 4.35
E2F4-201ENST00000379378 APLP2Q06481 763 aa42.16■■■■■ 4.34
E2F4-201ENST00000379378 CUL7Q14999 1698 aa42.1■■■■■ 4.33
E2F4-201ENST00000379378 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.06■■■■■ 4.32
E2F4-201ENST00000379378 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
E2F4-201ENST00000379378 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
E2F4-201ENST00000379378 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
E2F4-201ENST00000379378 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.93■■■■■ 4.3
E2F4-201ENST00000379378 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.92■■■■■ 4.3
E2F4-201ENST00000379378 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
E2F4-201ENST00000379378 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.81■■■■■ 4.28
E2F4-201ENST00000379378 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
E2F4-201ENST00000379378 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.68■■■■■ 4.26
E2F4-201ENST00000379378 WDR62O43379 1518 aa41.66■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms