RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548421.2

BRF1-213, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BRF1, Length 1,452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-213ENST00000548421 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.35■■■■■ 8.37
BRF1-213ENST00000548421 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.32■■■■■ 7.09
BRF1-213ENST00000548421 ABCC9O60706 1549 aa56.7■■■■■ 6.67
BRF1-213ENST00000548421 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.41■■■■■ 6.62
BRF1-213ENST00000548421 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.79■■■■■ 6.52
BRF1-213ENST00000548421 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.69■■■■■ 6.51
BRF1-213ENST00000548421 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.5■■■■■ 6.48
BRF1-213ENST00000548421 NACADO15069 1562 aa55.41■■■■■ 6.46
BRF1-213ENST00000548421 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.15■■■■■ 6.42
BRF1-213ENST00000548421 SCRIBQ14160 1630 aa54.25■■■■■ 6.28
BRF1-213ENST00000548421 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.06■■■■■ 6.24
BRF1-213ENST00000548421 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.01■■■■■ 6.24
BRF1-213ENST00000548421 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.44■■■■■ 6.15
BRF1-213ENST00000548421 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.19■■■■■ 6.1
BRF1-213ENST00000548421 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.3■■■■■ 5.96
BRF1-213ENST00000548421 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.13■■■■■ 5.93
BRF1-213ENST00000548421 SMARCA4P51532 1647 aa52.01■■■■■ 5.92
BRF1-213ENST00000548421 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.94■■■■■ 5.9
BRF1-213ENST00000548421 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.92■■■■■ 5.9
BRF1-213ENST00000548421 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.81■■■■■ 5.88
BRF1-213ENST00000548421 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.54■■■■■ 5.84
BRF1-213ENST00000548421 WIZO95785 1651 aa51.49■■■■■ 5.83
BRF1-213ENST00000548421 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.46■■■■■ 5.83
BRF1-213ENST00000548421 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.38■■■■■ 5.82
BRF1-213ENST00000548421 SMARCA2P51531 1590 aa51.36■■■■■ 5.81
BRF1-213ENST00000548421 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.33■■■■■ 5.81
BRF1-213ENST00000548421 NCAPD3P42695 1498 aa51.08■■■■■ 5.77
BRF1-213ENST00000548421 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.01■■■■■ 5.76
BRF1-213ENST00000548421 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51■■■■■ 5.75
BRF1-213ENST00000548421 HMGXB3Q12766 1538 aa51■■■■■ 5.75
BRF1-213ENST00000548421 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.81■■■■■ 5.72
BRF1-213ENST00000548421 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.37■■■■■ 5.65
BRF1-213ENST00000548421 CFTRP13569 1480 aa49.68■■■■■ 5.54
BRF1-213ENST00000548421 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.66■■■■■ 5.54
BRF1-213ENST00000548421 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.56■■■■■ 5.52
BRF1-213ENST00000548421 PRDM2Q13029 1718 aa49.54■■■■■ 5.52
BRF1-213ENST00000548421 NESP48681 1621 aa49.48■■■■■ 5.51
BRF1-213ENST00000548421 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.15■■■■■ 5.46
BRF1-213ENST00000548421 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.13■■■■■ 5.46
BRF1-213ENST00000548421 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49■■■■■ 5.43
BRF1-213ENST00000548421 ABCC8Q09428 1581 aa48.99■■■■■ 5.43
BRF1-213ENST00000548421 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.95■■■■■ 5.43
BRF1-213ENST00000548421 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.88■■■■■ 5.42
BRF1-213ENST00000548421 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.83■■■■■ 5.41
BRF1-213ENST00000548421 ERCC6Q03468 1493 aa48.78■■■■■ 5.4
BRF1-213ENST00000548421 SYNJ1O43426 1573 aa48.68■■■■■ 5.38
BRF1-213ENST00000548421 CUX1P39880 1505 aa48.65■■■■■ 5.38
BRF1-213ENST00000548421 TOP2BQ02880 1626 aa48.62■■■■■ 5.37
BRF1-213ENST00000548421 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.62■■■■■ 5.37
BRF1-213ENST00000548421 TRIM41Q8WV44 630 aa48.61■■■■■ 5.37
BRF1-213ENST00000548421 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.58■■■■■ 5.37
BRF1-213ENST00000548421 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.58■■■■■ 5.37
BRF1-213ENST00000548421 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.55■■■■■ 5.36
BRF1-213ENST00000548421 TOPBP1Q92547 1522 aa48.5■■■■■ 5.35
BRF1-213ENST00000548421 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
BRF1-213ENST00000548421 WDR62O43379 1518 aa48.39■■■■■ 5.34
BRF1-213ENST00000548421 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.27■■■■■ 5.32
BRF1-213ENST00000548421 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.19■■■■■ 5.3
BRF1-213ENST00000548421 SOGA1O94964 1423 aa47.98■■■■■ 5.27
BRF1-213ENST00000548421 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.96■■■■■ 5.27
BRF1-213ENST00000548421 CUX2O14529 1486 aa47.95■■■■■ 5.27
BRF1-213ENST00000548421 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
BRF1-213ENST00000548421 WDR97A6NE52 1622 aa47.87■■■■■ 5.25
BRF1-213ENST00000548421 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.86■■■■■ 5.25
BRF1-213ENST00000548421 IFT140Q96RY7 1462 aa47.84■■■■■ 5.25
BRF1-213ENST00000548421 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.7■■■■■ 5.23
BRF1-213ENST00000548421 EEA1Q15075 1411 aa47.7■■■■■ 5.23
BRF1-213ENST00000548421 KIF27Q86VH2 1401 aa47.7■■■■■ 5.23
BRF1-213ENST00000548421 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.59■■■■■ 5.21
BRF1-213ENST00000548421 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.59■■■■■ 5.21
BRF1-213ENST00000548421 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
BRF1-213ENST00000548421 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
BRF1-213ENST00000548421 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.48■■■■■ 5.19
BRF1-213ENST00000548421 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
BRF1-213ENST00000548421 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.42■■■■■ 5.183e-6■■□□□ 13.8
BRF1-213ENST00000548421 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.4■■■■■ 5.18
BRF1-213ENST00000548421 PBRM1Q86U86 1689 aa47.37■■■■■ 5.17
BRF1-213ENST00000548421 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.32■■■■■ 5.17
BRF1-213ENST00000548421 IGF1RP08069 1367 aa47.31■■■■■ 5.16
BRF1-213ENST00000548421 GRIN2BQ13224 1484 aa47.28■■■■■ 5.16
BRF1-213ENST00000548421 CUL7Q14999 1698 aa47.2■■■■■ 5.15
BRF1-213ENST00000548421 KIF21BO75037 1637 aa47.15■■■■■ 5.14
BRF1-213ENST00000548421 PRXQ9BXM0 1461 aa47.13■■■■■ 5.14
BRF1-213ENST00000548421 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.07■■■■■ 5.13
BRF1-213ENST00000548421 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.04■■■■■ 5.12
BRF1-213ENST00000548421 ADAMTS12P58397 1594 aa47.03■■■■■ 5.12
BRF1-213ENST00000548421 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.01■■■■■ 5.12
BRF1-213ENST00000548421 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.96■■■■■ 5.11
BRF1-213ENST00000548421 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.95■■■■■ 5.11
BRF1-213ENST00000548421 GOLGA3Q08378 1498 aa46.95■■■■■ 5.11
BRF1-213ENST00000548421 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.89■■■■■ 5.1
BRF1-213ENST00000548421 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.87■■■■■ 5.09
BRF1-213ENST00000548421 SYNJ2O15056 1496 aa46.81■■■■■ 5.08
BRF1-213ENST00000548421 GRIN2AQ12879 1464 aa46.69■■■■■ 5.06
BRF1-213ENST00000548421 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
BRF1-213ENST00000548421 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
BRF1-213ENST00000548421 CHD1O14646 1710 aa46.61■■■■■ 5.05
BRF1-213ENST00000548421 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.59■■■■■ 5.05
BRF1-213ENST00000548421 FBLN2P98095 1184 aa46.57■■■■■ 5.05
BRF1-213ENST00000548421 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.55■■■■■ 5.04
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