RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589716.5

RAMP2-AS1-202, RAMP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RAMP2-AS1, Length 1,985 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.08■■■■■ 6.89
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RAMP2-AS1-202ENST00000589716 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.5■■■■■ 5.36
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.01■■■■■ 5.28
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.98■■■■■ 5.27
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.39■■■■■ 5.18
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RAMP2-AS1-202ENST00000589716 NACADO15069 1562 aa47.32■■■■■ 5.17
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.08■■■■■ 5.13
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RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.07■■■■■ 4.97
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RAMP2-AS1-202ENST00000589716 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.74■■■■■ 4.91
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.64■■■■■ 4.9
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.07■■■■■ 4.81
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.98■■■■■ 4.79
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 WIZO95785 1651 aa44.71■■■■■ 4.75
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 SMARCA4P51532 1647 aa44.53■■■■■ 4.72
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RAMP2-AS1-202ENST00000589716 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.4■■■■■ 4.7
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 TRIM41Q8WV44 630 aa44.38■■■■■ 4.69
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.01■■■■■ 4.64
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 PEG3Q9GZU2 1588 aa44■■■■■ 4.63
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.93■■■■■ 4.62
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.9■■■■■ 4.62
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 SMARCA2P51531 1590 aa43.89■■■■■ 4.62
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.82■■■■■ 4.61
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 HRCP23327 699 aa43.81■■■■■ 4.6
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RAMP2-AS1-202ENST00000589716 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.59
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.59■■■■■ 4.57
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 HMGXB3Q12766 1538 aa43.57■■■■■ 4.57
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 ABCC8Q09428 1581 aa43.41■■■■■ 4.54
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.03■■■■■ 4.48
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 EEA1Q15075 1411 aa43.02■■■■■ 4.48
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.46
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 SOGA1O94964 1423 aa42.88■■■■■ 4.46
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 SYNJ1O43426 1573 aa42.72■■■■■ 4.43
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.67■■■■■ 4.42
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.67■■■■■ 4.42
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.65■■■■■ 4.42
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CEP162Q5TB80 1403 aa42.58■■■■■ 4.41
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.57■■■■■ 4.41
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CFTRP13569 1480 aa42.57■■■■■ 4.41
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 GOLGA3Q08378 1498 aa42.53■■■■■ 4.4
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RAMP2-AS1-202ENST00000589716 NESP48681 1621 aa42.48■■■■■ 4.39
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RAMP2-AS1-202ENST00000589716 TOP2BQ02880 1626 aa42.39■■■■■ 4.38
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.37■■■■■ 4.37
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.33■■■■■ 4.37
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.31■■■■■ 4.36
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RAMP2-AS1-202ENST00000589716 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.1■■■■■ 4.33
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.03■■■■■ 4.32
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CUX1P39880 1505 aa41.96■■■■■ 4.31
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.94■■■■■ 4.3
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CLIP1P30622 1438 aa41.9■■■■■ 4.3
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.87■■■■■ 4.29
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.86■■■■■ 4.29
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 PRXQ9BXM0 1461 aa41.78■■■■■ 4.28
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.74■■■■■ 4.27
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 ERCC6Q03468 1493 aa41.69■■■■■ 4.26
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 KIF27Q86VH2 1401 aa41.67■■■■■ 4.26
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.24
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 TOPBP1Q92547 1522 aa41.56■■■■■ 4.24
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.55■■■■■ 4.24
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.53■■■■■ 4.24
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.41■■■■■ 4.22
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 WDR62O43379 1518 aa41.34■■■■■ 4.21
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 ARAP1Q96P48 1450 aa41.34■■■■■ 4.21
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 APLP2Q06481 763 aa41.34■■■■■ 4.21
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CUX2O14529 1486 aa41.27■■■■■ 4.2
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.22■■■■■ 4.19
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 IGF1RP08069 1367 aa41.17■■■■■ 4.18
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.05■■■■■ 4.16
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.01■■■■■ 4.16
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.99■■■■■ 4.15
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 IFT140Q96RY7 1462 aa40.92■■■■■ 4.14
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 WDR97A6NE52 1622 aa40.9■■■■■ 4.14
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
RAMP2-AS1-202ENST00000589716 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
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