RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360274.8

PRKAR1B-201, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1B, Length 2,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1B-201ENST00000360274 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.98■■■■■ 7.67
PRKAR1B-201ENST00000360274 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.68■■■■■ 6.34
PRKAR1B-201ENST00000360274 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53■■■■■ 6.07
PRKAR1B-201ENST00000360274 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52■■■■■ 5.91
PRKAR1B-201ENST00000360274 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.94■■■■■ 5.91
PRKAR1B-201ENST00000360274 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.82■■■■■ 5.89
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCC9O60706 1549 aa51.41■■■■■ 5.82
PRKAR1B-201ENST00000360274 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.19■■■■■ 5.78
PRKAR1B-201ENST00000360274 NACADO15069 1562 aa50.8■■■■■ 5.72
PRKAR1B-201ENST00000360274 SCRIBQ14160 1630 aa50.46■■■■■ 5.67
PRKAR1B-201ENST00000360274 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.29■■■■■ 5.64
PRKAR1B-201ENST00000360274 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.03■■■■■ 5.6
PRKAR1B-201ENST00000360274 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.43■■■■■ 5.5
PRKAR1B-201ENST00000360274 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.05■■■■■ 5.44
PRKAR1B-201ENST00000360274 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.98■■■■■ 5.43
PRKAR1B-201ENST00000360274 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.85■■■■■ 5.41
PRKAR1B-201ENST00000360274 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.73■■■■■ 5.39
PRKAR1B-201ENST00000360274 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.59■■■■■ 5.37
PRKAR1B-201ENST00000360274 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.57■■■■■ 5.37
PRKAR1B-201ENST00000360274 WIZO95785 1651 aa48.4■■■■■ 5.34
PRKAR1B-201ENST00000360274 SMARCA4P51532 1647 aa48.35■■■■■ 5.33
PRKAR1B-201ENST00000360274 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.09■■■■■ 5.29
PRKAR1B-201ENST00000360274 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
PRKAR1B-201ENST00000360274 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.69■■■■■ 5.22
PRKAR1B-201ENST00000360274 SMARCA2P51531 1590 aa47.42■■■■■ 5.18
PRKAR1B-201ENST00000360274 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.42■■■■■ 5.18
PRKAR1B-201ENST00000360274 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.37■■■■■ 5.17
PRKAR1B-201ENST00000360274 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
PRKAR1B-201ENST00000360274 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.18■■■■■ 5.14
PRKAR1B-201ENST00000360274 TRIM41Q8WV44 630 aa46.95■■■■■ 5.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 NCAPD3P42695 1498 aa46.9■■■■■ 5.1
PRKAR1B-201ENST00000360274 HMGXB3Q12766 1538 aa46.88■■■■■ 5.09
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCC8Q09428 1581 aa46.58■■■■■ 5.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.53■■■■■ 5.04
PRKAR1B-201ENST00000360274 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.33■■■■■ 5.01
PRKAR1B-201ENST00000360274 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
PRKAR1B-201ENST00000360274 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.14■■■■■ 4.988e-6■■■■■ 51.9
PRKAR1B-201ENST00000360274 CFTRP13569 1480 aa46.01■■■■■ 4.96
PRKAR1B-201ENST00000360274 SYNJ1O43426 1573 aa46■■■■■ 4.95
PRKAR1B-201ENST00000360274 PRDM2Q13029 1718 aa45.84■■■■■ 4.93
PRKAR1B-201ENST00000360274 SOGA1O94964 1423 aa45.77■■■■■ 4.92
PRKAR1B-201ENST00000360274 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.74■■■■■ 4.91
PRKAR1B-201ENST00000360274 TOP2BQ02880 1626 aa45.73■■■■■ 4.91
PRKAR1B-201ENST00000360274 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.68■■■■■ 4.9
PRKAR1B-201ENST00000360274 EEA1Q15075 1411 aa45.64■■■■■ 4.9
PRKAR1B-201ENST00000360274 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.61■■■■■ 4.89
PRKAR1B-201ENST00000360274 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.6■■■■■ 4.89
PRKAR1B-201ENST00000360274 CUX1P39880 1505 aa45.53■■■■■ 4.88
PRKAR1B-201ENST00000360274 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.4■■■■■ 4.86
PRKAR1B-201ENST00000360274 NESP48681 1621 aa45.31■■■■■ 4.84
PRKAR1B-201ENST00000360274 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.31■■■■■ 4.84
PRKAR1B-201ENST00000360274 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.28■■■■■ 4.84
PRKAR1B-201ENST00000360274 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.24■■■■■ 4.83
PRKAR1B-201ENST00000360274 KIF21BO75037 1637 aa45.1■■■■■ 4.81
PRKAR1B-201ENST00000360274 GOLGA3Q08378 1498 aa45.1■■■■■ 4.81
PRKAR1B-201ENST00000360274 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.05■■■■■ 4.8
PRKAR1B-201ENST00000360274 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.02■■■■■ 4.8
PRKAR1B-201ENST00000360274 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.95■■■■■ 4.79
PRKAR1B-201ENST00000360274 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.94■■■■■ 4.78
PRKAR1B-201ENST00000360274 KIF27Q86VH2 1401 aa44.9■■■■■ 4.78
PRKAR1B-201ENST00000360274 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
PRKAR1B-201ENST00000360274 CEP162Q5TB80 1403 aa44.87■■■■■ 4.77
PRKAR1B-201ENST00000360274 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.86■■■■■ 4.77
PRKAR1B-201ENST00000360274 TOPBP1Q92547 1522 aa44.85■■■■■ 4.77
PRKAR1B-201ENST00000360274 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.81■■■■■ 4.76
PRKAR1B-201ENST00000360274 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.76■■■■■ 4.76
PRKAR1B-201ENST00000360274 CUX2O14529 1486 aa44.74■■■■■ 4.75
PRKAR1B-201ENST00000360274 PRXQ9BXM0 1461 aa44.74■■■■■ 4.75
PRKAR1B-201ENST00000360274 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
PRKAR1B-201ENST00000360274 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.69■■■■■ 4.75
PRKAR1B-201ENST00000360274 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
PRKAR1B-201ENST00000360274 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.65■■■■■ 4.74
PRKAR1B-201ENST00000360274 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.56■■■■■ 4.72
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.52■■■■■ 4.72
PRKAR1B-201ENST00000360274 IGF1RP08069 1367 aa44.49■■■■■ 4.71
PRKAR1B-201ENST00000360274 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
PRKAR1B-201ENST00000360274 CLIP1P30622 1438 aa44.4■■■■■ 4.7
PRKAR1B-201ENST00000360274 WDR97A6NE52 1622 aa44.4■■■■■ 4.7
PRKAR1B-201ENST00000360274 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.29■■■■■ 4.68
PRKAR1B-201ENST00000360274 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.26■■■■■ 4.68
PRKAR1B-201ENST00000360274 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.17■■■■■ 4.66
PRKAR1B-201ENST00000360274 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
PRKAR1B-201ENST00000360274 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.66
PRKAR1B-201ENST00000360274 CUL7Q14999 1698 aa44.1■■■■■ 4.65
PRKAR1B-201ENST00000360274 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
PRKAR1B-201ENST00000360274 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.07■■■■■ 4.64
PRKAR1B-201ENST00000360274 WDR62O43379 1518 aa44.06■■■■■ 4.64
PRKAR1B-201ENST00000360274 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.02■■■■■ 4.64
PRKAR1B-201ENST00000360274 ERCC6Q03468 1493 aa43.99■■■■■ 4.63
PRKAR1B-201ENST00000360274 ARAP1Q96P48 1450 aa43.95■■■■■ 4.63
PRKAR1B-201ENST00000360274 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
PRKAR1B-201ENST00000360274 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.85■■■■■ 4.61
PRKAR1B-201ENST00000360274 IFT140Q96RY7 1462 aa43.8■■■■■ 4.6
PRKAR1B-201ENST00000360274 PBRM1Q86U86 1689 aa43.8■■■■■ 4.6
PRKAR1B-201ENST00000360274 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
PRKAR1B-201ENST00000360274 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.73■■■■■ 4.59
PRKAR1B-201ENST00000360274 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.73■■■■■ 4.59
PRKAR1B-201ENST00000360274 HRCP23327 699 aa43.68■■■■■ 4.58
PRKAR1B-201ENST00000360274 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms