RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396914.3

CHCHD4-202, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-202ENST00000396914 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.42■■■■■ 8.86
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CHCHD4-202ENST00000396914 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.65■■■■■ 6.98
CHCHD4-202ENST00000396914 NACADO15069 1562 aa58.62■■■■■ 6.97
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CHCHD4-202ENST00000396914 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.19■■■■■ 6.91
CHCHD4-202ENST00000396914 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.29■■■■■ 6.76
CHCHD4-202ENST00000396914 SCRIBQ14160 1630 aa57.12■■■■■ 6.74
CHCHD4-202ENST00000396914 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.99■■■■■ 6.71
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CHCHD4-202ENST00000396914 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.16■■■■■ 6.58
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CHCHD4-202ENST00000396914 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.02■■■■■ 6.4
CHCHD4-202ENST00000396914 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.85■■■■■ 6.37
CHCHD4-202ENST00000396914 SMARCA4P51532 1647 aa54.58■■■■■ 6.33
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CHCHD4-202ENST00000396914 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.32■■■■■ 6.29
CHCHD4-202ENST00000396914 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.19■■■■■ 6.26
CHCHD4-202ENST00000396914 SMARCA2P51531 1590 aa54.16■■■■■ 6.26
CHCHD4-202ENST00000396914 NCAPD3P42695 1498 aa54.05■■■■■ 6.24
CHCHD4-202ENST00000396914 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.94■■■■■ 6.23
CHCHD4-202ENST00000396914 HMGXB3Q12766 1538 aa53.83■■■■■ 6.21
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CHCHD4-202ENST00000396914 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.81■■■■■ 6.21
CHCHD4-202ENST00000396914 WIZO95785 1651 aa53.78■■■■■ 6.2
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CHCHD4-202ENST00000396914 NESP48681 1621 aa52.75■■■■■ 6.03
CHCHD4-202ENST00000396914 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.62■■■■■ 6.01
CHCHD4-202ENST00000396914 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.58■■■■■ 6.01
CHCHD4-202ENST00000396914 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.57■■■■■ 6.01
CHCHD4-202ENST00000396914 ERCC6Q03468 1493 aa52.49■■■■■ 5.99
CHCHD4-202ENST00000396914 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.3■■■■■ 5.96
CHCHD4-202ENST00000396914 CFTRP13569 1480 aa52.29■■■■■ 5.96
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.14■■■■■ 5.94
CHCHD4-202ENST00000396914 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52■■■■■ 5.91
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CHCHD4-202ENST00000396914 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.91■■■■■ 5.9
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CHCHD4-202ENST00000396914 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.73■■■■■ 5.87
CHCHD4-202ENST00000396914 CUX2O14529 1486 aa51.65■■■■■ 5.86
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CHCHD4-202ENST00000396914 TOPBP1Q92547 1522 aa51.18■■■■■ 5.78
CHCHD4-202ENST00000396914 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.15■■■■■ 5.78
CHCHD4-202ENST00000396914 CUX1P39880 1505 aa50.93■■■■■ 5.74
CHCHD4-202ENST00000396914 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.78■■■■■ 5.72
CHCHD4-202ENST00000396914 IFT140Q96RY7 1462 aa50.77■■■■■ 5.72
CHCHD4-202ENST00000396914 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.77■■■■■ 5.72
CHCHD4-202ENST00000396914 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.73■■■■■ 5.71
CHCHD4-202ENST00000396914 SOGA1O94964 1423 aa50.62■■■■■ 5.69
CHCHD4-202ENST00000396914 SYNJ1O43426 1573 aa50.61■■■■■ 5.69
CHCHD4-202ENST00000396914 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.6■■■■■ 5.69
CHCHD4-202ENST00000396914 TOP2BQ02880 1626 aa50.57■■■■■ 5.69
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CHCHD4-202ENST00000396914 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.31■■■■■ 5.64
CHCHD4-202ENST00000396914 WDR97A6NE52 1622 aa50.22■■■■■ 5.63
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.2■■■■■ 5.63
CHCHD4-202ENST00000396914 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.02■■■■■ 5.6
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.96■■■■■ 5.59
CHCHD4-202ENST00000396914 GRIN2BQ13224 1484 aa49.96■■■■■ 5.59
CHCHD4-202ENST00000396914 TRIM41Q8WV44 630 aa49.95■■■■■ 5.59
CHCHD4-202ENST00000396914 PBRM1Q86U86 1689 aa49.9■■■■■ 5.58
CHCHD4-202ENST00000396914 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.86■■■■■ 5.57
CHCHD4-202ENST00000396914 FBLN2P98095 1184 aa49.82■■■■■ 5.57
CHCHD4-202ENST00000396914 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.75■■■■■ 5.56
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF27Q86VH2 1401 aa49.7■■■■■ 5.55
CHCHD4-202ENST00000396914 OSCARQ8IYS5 282 aa49.68■■■■■ 5.54
CHCHD4-202ENST00000396914 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.68■■■■■ 5.54
CHCHD4-202ENST00000396914 CHD1O14646 1710 aa49.67■■■■■ 5.54
CHCHD4-202ENST00000396914 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.65■■■■■ 5.54
CHCHD4-202ENST00000396914 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.61■■■■■ 5.53
CHCHD4-202ENST00000396914 SYNJ2O15056 1496 aa49.57■■■■■ 5.53
CHCHD4-202ENST00000396914 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.5■■■■■ 5.51
CHCHD4-202ENST00000396914 ADAMTS12P58397 1594 aa49.48■■■■■ 5.51
CHCHD4-202ENST00000396914 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.44■■■■■ 5.51
CHCHD4-202ENST00000396914 IGF1RP08069 1367 aa49.41■■■■■ 5.5
CHCHD4-202ENST00000396914 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.36■■■■■ 5.49
CHCHD4-202ENST00000396914 GRIN2AQ12879 1464 aa49.31■■■■■ 5.48
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CHCHD4-202ENST00000396914 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.17■■■■■ 5.46
CHCHD4-202ENST00000396914 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.05■■■■■ 5.44
CHCHD4-202ENST00000396914 CEP170Q5SW79 1584 aa49.04■■■■■ 5.44
CHCHD4-202ENST00000396914 NUP160Q12769 1436 aa49.01■■■■■ 5.44
CHCHD4-202ENST00000396914 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49■■■■■ 5.43
CHCHD4-202ENST00000396914 EEA1Q15075 1411 aa48.95■■■■■ 5.43
CHCHD4-202ENST00000396914 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.91■■■■■ 5.42
CHCHD4-202ENST00000396914 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.91■■■■■ 5.42
CHCHD4-202ENST00000396914 ARHGEF11O15085 1522 aa48.82■■■■■ 5.41
CHCHD4-202ENST00000396914 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.8■■■■■ 5.4
CHCHD4-202ENST00000396914 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.8■■■■■ 5.4
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