RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369476.7

MTCP1-202, Transcript of mature T cell proliferation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene MTCP1, Length 2,274 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1-202ENST00000369476 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.64■■■■■ 7.46
MTCP1-202ENST00000369476 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.21■■■■■ 6.11
MTCP1-202ENST00000369476 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.9■■■■■ 5.9
MTCP1-202ENST00000369476 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.24■■■■■ 5.79
MTCP1-202ENST00000369476 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.09■■■■■ 5.77
MTCP1-202ENST00000369476 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.74■■■■■ 5.71
MTCP1-202ENST00000369476 ABCC9O60706 1549 aa50.1■■■■■ 5.61
MTCP1-202ENST00000369476 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.8■■■■■ 5.56
MTCP1-202ENST00000369476 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.6■■■■■ 5.53
MTCP1-202ENST00000369476 NACADO15069 1562 aa49.44■■■■■ 5.5
MTCP1-202ENST00000369476 SCRIBQ14160 1630 aa49.4■■■■■ 5.5
MTCP1-202ENST00000369476 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.89■■■■■ 5.42
MTCP1-202ENST00000369476 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.18■■■■■ 5.3
MTCP1-202ENST00000369476 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.12■■■■■ 5.29
MTCP1-202ENST00000369476 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.04■■■■■ 5.28
MTCP1-202ENST00000369476 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.78■■■■■ 5.24
MTCP1-202ENST00000369476 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.72■■■■■ 5.23
MTCP1-202ENST00000369476 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.56■■■■■ 5.2
MTCP1-202ENST00000369476 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.53■■■■■ 5.2
MTCP1-202ENST00000369476 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.47■■■■■ 5.19
MTCP1-202ENST00000369476 WIZO95785 1651 aa47.46■■■■■ 5.19
MTCP1-202ENST00000369476 SMARCA4P51532 1647 aa47.24■■■■■ 5.15
MTCP1-202ENST00000369476 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
MTCP1-202ENST00000369476 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.49■■■■■ 5.03
MTCP1-202ENST00000369476 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.47■■■■■ 5.03
MTCP1-202ENST00000369476 SMARCA2P51531 1590 aa46.47■■■■■ 5.03
MTCP1-202ENST00000369476 TRIM41Q8WV44 630 aa46.41■■■■■ 5.02
MTCP1-202ENST00000369476 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
MTCP1-202ENST00000369476 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.31■■■■■ 5
MTCP1-202ENST00000369476 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.12■■■■■ 4.97
MTCP1-202ENST00000369476 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
MTCP1-202ENST00000369476 ABCC8Q09428 1581 aa45.85■■■■■ 4.93
MTCP1-202ENST00000369476 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.84■■■■■ 4.93
MTCP1-202ENST00000369476 NCAPD3P42695 1498 aa45.69■■■■■ 4.9
MTCP1-202ENST00000369476 HMGXB3Q12766 1538 aa45.63■■■■■ 4.9
MTCP1-202ENST00000369476 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.36■■■■■ 4.85
MTCP1-202ENST00000369476 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.31■■■■■ 4.84
MTCP1-202ENST00000369476 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.23■■■■■ 4.83
MTCP1-202ENST00000369476 SYNJ1O43426 1573 aa45.16■■■■■ 4.82
MTCP1-202ENST00000369476 SOGA1O94964 1423 aa45.14■■■■■ 4.82
MTCP1-202ENST00000369476 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.98■■■■■ 4.79
MTCP1-202ENST00000369476 CFTRP13569 1480 aa44.92■■■■■ 4.78
MTCP1-202ENST00000369476 EEA1Q15075 1411 aa44.83■■■■■ 4.77
MTCP1-202ENST00000369476 TOP2BQ02880 1626 aa44.78■■■■■ 4.76
MTCP1-202ENST00000369476 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.77■■■■■ 4.76
MTCP1-202ENST00000369476 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.72■■■■■ 4.75
MTCP1-202ENST00000369476 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.69■■■■■ 4.74
MTCP1-202ENST00000369476 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.65■■■■■ 4.74
MTCP1-202ENST00000369476 PRDM2Q13029 1718 aa44.64■■■■■ 4.74
MTCP1-202ENST00000369476 CUX1P39880 1505 aa44.6■■■■■ 4.73
MTCP1-202ENST00000369476 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.41■■■■■ 4.7
MTCP1-202ENST00000369476 GOLGA3Q08378 1498 aa44.4■■■■■ 4.7
MTCP1-202ENST00000369476 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.69
MTCP1-202ENST00000369476 CEP162Q5TB80 1403 aa44.32■■■■■ 4.69
MTCP1-202ENST00000369476 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.69
MTCP1-202ENST00000369476 KIF21BO75037 1637 aa44.31■■■■■ 4.68
MTCP1-202ENST00000369476 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.31■■■■■ 4.68
MTCP1-202ENST00000369476 NESP48681 1621 aa44.25■■■■■ 4.67
MTCP1-202ENST00000369476 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.23■■■■■ 4.67
MTCP1-202ENST00000369476 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.21■■■■■ 4.67
MTCP1-202ENST00000369476 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.13■■■■■ 4.66
MTCP1-202ENST00000369476 KIF27Q86VH2 1401 aa44.04■■■■■ 4.64
MTCP1-202ENST00000369476 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
MTCP1-202ENST00000369476 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44■■■■■ 4.63
MTCP1-202ENST00000369476 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.99■■■■■ 4.63
MTCP1-202ENST00000369476 PRXQ9BXM0 1461 aa43.94■■■■■ 4.62
MTCP1-202ENST00000369476 HRCP23327 699 aa43.88■■■■■ 4.62
MTCP1-202ENST00000369476 CUX2O14529 1486 aa43.87■■■■■ 4.61
MTCP1-202ENST00000369476 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.85■■■■■ 4.61
MTCP1-202ENST00000369476 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.84■■■■■ 4.61
MTCP1-202ENST00000369476 TOPBP1Q92547 1522 aa43.8■■■■■ 4.6
MTCP1-202ENST00000369476 CLIP1P30622 1438 aa43.8■■■■■ 4.6
MTCP1-202ENST00000369476 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
MTCP1-202ENST00000369476 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.67■■■■■ 4.58
MTCP1-202ENST00000369476 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
MTCP1-202ENST00000369476 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.66■■■■■ 4.58
MTCP1-202ENST00000369476 IGF1RP08069 1367 aa43.66■■■■■ 4.58
MTCP1-202ENST00000369476 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
MTCP1-202ENST00000369476 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.6■■■■■ 4.57
MTCP1-202ENST00000369476 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
MTCP1-202ENST00000369476 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.51■■■■■ 4.56
MTCP1-202ENST00000369476 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.46■■■■■ 4.55
MTCP1-202ENST00000369476 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.45■■■■■ 4.55
MTCP1-202ENST00000369476 WDR97A6NE52 1622 aa43.3■■■■■ 4.52
MTCP1-202ENST00000369476 ARAP1Q96P48 1450 aa43.3■■■■■ 4.52
MTCP1-202ENST00000369476 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
MTCP1-202ENST00000369476 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.15■■■■■ 4.5
MTCP1-202ENST00000369476 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.12■■■■■ 4.49
MTCP1-202ENST00000369476 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.11■■■■■ 4.49
MTCP1-202ENST00000369476 APLP2Q06481 763 aa43.09■■■■■ 4.49
MTCP1-202ENST00000369476 CUL7Q14999 1698 aa43.09■■■■■ 4.49
MTCP1-202ENST00000369476 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
MTCP1-202ENST00000369476 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.04■■■■■ 4.48
MTCP1-202ENST00000369476 WDR62O43379 1518 aa42.82■■■■■ 4.45
MTCP1-202ENST00000369476 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.8■■■■■ 4.44
MTCP1-202ENST00000369476 ERCC6Q03468 1493 aa42.78■■■■■ 4.44
MTCP1-202ENST00000369476 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.77■■■■■ 4.44
MTCP1-202ENST00000369476 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
MTCP1-202ENST00000369476 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
MTCP1-202ENST00000369476 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms