Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TPM4P67936 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TPM4P67936 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TPM4P67936 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TPM4P67936 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TPM4P67936 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TPM4P67936 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TPM4P67936 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TPM4P67936 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TPM4P67936 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TPM4P67936 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TPM4P67936 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TPM4P67936 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TPM4P67936 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TPM4P67936 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TPM4P67936 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TPM4P67936 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TPM4P67936 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TPM4P67936 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TPM4P67936 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TPM4P67936 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TPM4P67936 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TPM4P67936 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TPM4P67936 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TPM4P67936 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TPM4P67936 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TPM4P67936 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TPM4P67936 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TPM4P67936 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TPM4P67936 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TPM4P67936 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TPM4P67936 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TPM4P67936 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TPM4P67936 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TPM4P67936 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TPM4P67936 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TPM4P67936 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TPM4P67936 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TPM4P67936 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TPM4P67936 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TPM4P67936 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TPM4P67936 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TPM4P67936 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TPM4P67936 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TPM4P67936 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TPM4P67936 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TPM4P67936 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TPM4P67936 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TPM4P67936 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TPM4P67936 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TPM4P67936 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TPM4P67936 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TPM4P67936 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TPM4P67936 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TPM4P67936 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TPM4P67936 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TPM4P67936 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TPM4P67936 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TPM4P67936 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TPM4P67936 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TPM4P67936 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TPM4P67936 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TPM4P67936 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TPM4P67936 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TPM4P67936 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TPM4P67936 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TPM4P67936 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TPM4P67936 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TPM4P67936 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TPM4P67936 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TPM4P67936 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TPM4P67936 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TPM4P67936 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TPM4P67936 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TPM4P67936 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TPM4P67936 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TPM4P67936 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TPM4P67936 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TPM4P67936 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TPM4P67936 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TPM4P67936 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TPM4P67936 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TPM4P67936 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TPM4P67936 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TPM4P67936 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TPM4P67936 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TPM4P67936 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TPM4P67936 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TPM4P67936 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TPM4P67936 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TPM4P67936 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TPM4P67936 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TPM4P67936 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TPM4P67936 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TPM4P67936 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TPM4P67936 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TPM4P67936 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TPM4P67936 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TPM4P67936 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TPM4P67936 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms