RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394725.2

SIAH1-203, Transcript of siah E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIAH1, Length 2,147 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH1-203ENST00000394725 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.29■■■■■ 7.4
SIAH1-203ENST00000394725 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.73■■■■■ 6.03
SIAH1-203ENST00000394725 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.65■■■■■ 5.86
SIAH1-203ENST00000394725 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.18■■■■■ 5.78
SIAH1-203ENST00000394725 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.82■■■■■ 5.73
SIAH1-203ENST00000394725 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.43■■■■■ 5.66
SIAH1-203ENST00000394725 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.7■■■■■ 5.55
SIAH1-203ENST00000394725 ABCC9O60706 1549 aa49.51■■■■■ 5.52
SIAH1-203ENST00000394725 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.41■■■■■ 5.5
SIAH1-203ENST00000394725 SCRIBQ14160 1630 aa49.04■■■■■ 5.44
SIAH1-203ENST00000394725 NACADO15069 1562 aa48.98■■■■■ 5.43
SIAH1-203ENST00000394725 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.38■■■■■ 5.34
SIAH1-203ENST00000394725 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.03■■■■■ 5.28
SIAH1-203ENST00000394725 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.91■■■■■ 5.26
SIAH1-203ENST00000394725 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.77■■■■■ 5.24
SIAH1-203ENST00000394725 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.55■■■■■ 5.2
SIAH1-203ENST00000394725 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.53■■■■■ 5.2
SIAH1-203ENST00000394725 WIZO95785 1651 aa47.2■■■■■ 5.15
SIAH1-203ENST00000394725 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.18■■■■■ 5.14
SIAH1-203ENST00000394725 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.06■■■■■ 5.12
SIAH1-203ENST00000394725 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.04■■■■■ 5.12
SIAH1-203ENST00000394725 SMARCA4P51532 1647 aa46.9■■■■■ 5.1
SIAH1-203ENST00000394725 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
SIAH1-203ENST00000394725 TRIM41Q8WV44 630 aa46.48■■■■■ 5.03
SIAH1-203ENST00000394725 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.34■■■■■ 5.01
SIAH1-203ENST00000394725 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.26■■■■■ 5
SIAH1-203ENST00000394725 SMARCA2P51531 1590 aa46.22■■■■■ 4.99
SIAH1-203ENST00000394725 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
SIAH1-203ENST00000394725 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.14■■■■■ 4.98
SIAH1-203ENST00000394725 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.95■■■■■ 4.95
SIAH1-203ENST00000394725 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
SIAH1-203ENST00000394725 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
SIAH1-203ENST00000394725 ABCC8Q09428 1581 aa45.71■■■■■ 4.91
SIAH1-203ENST00000394725 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.44■■■■■ 4.86
SIAH1-203ENST00000394725 NCAPD3P42695 1498 aa45.29■■■■■ 4.84
SIAH1-203ENST00000394725 HMGXB3Q12766 1538 aa45.22■■■■■ 4.83
SIAH1-203ENST00000394725 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.2■■■■■ 4.83
SIAH1-203ENST00000394725 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.15■■■■■ 4.82
SIAH1-203ENST00000394725 SOGA1O94964 1423 aa45.07■■■■■ 4.81
SIAH1-203ENST00000394725 SYNJ1O43426 1573 aa44.96■■■■■ 4.79
SIAH1-203ENST00000394725 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.89■■■■■ 4.78
SIAH1-203ENST00000394725 EEA1Q15075 1411 aa44.82■■■■■ 4.76
SIAH1-203ENST00000394725 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.76■■■■■ 4.76
SIAH1-203ENST00000394725 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
SIAH1-203ENST00000394725 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.67■■■■■ 4.74
SIAH1-203ENST00000394725 CFTRP13569 1480 aa44.6■■■■■ 4.73
SIAH1-203ENST00000394725 TOP2BQ02880 1626 aa44.57■■■■■ 4.73
SIAH1-203ENST00000394725 HRCP23327 699 aa44.53■■■■■ 4.72
SIAH1-203ENST00000394725 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.45■■■■■ 4.71
SIAH1-203ENST00000394725 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.45■■■■■ 4.71
SIAH1-203ENST00000394725 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
SIAH1-203ENST00000394725 GOLGA3Q08378 1498 aa44.39■■■■■ 4.7
SIAH1-203ENST00000394725 CEP162Q5TB80 1403 aa44.39■■■■■ 4.7
SIAH1-203ENST00000394725 CUX1P39880 1505 aa44.34■■■■■ 4.69
SIAH1-203ENST00000394725 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.3■■■■■ 4.68
SIAH1-203ENST00000394725 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.27■■■■■ 4.68
SIAH1-203ENST00000394725 KIF21BO75037 1637 aa44.24■■■■■ 4.67
SIAH1-203ENST00000394725 PRDM2Q13029 1718 aa44.23■■■■■ 4.67
SIAH1-203ENST00000394725 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
SIAH1-203ENST00000394725 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.05■■■■■ 4.64
SIAH1-203ENST00000394725 KIF27Q86VH2 1401 aa43.88■■■■■ 4.62
SIAH1-203ENST00000394725 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.85■■■■■ 4.61
SIAH1-203ENST00000394725 PRXQ9BXM0 1461 aa43.83■■■■■ 4.61
SIAH1-203ENST00000394725 CLIP1P30622 1438 aa43.8■■■■■ 4.6
SIAH1-203ENST00000394725 NESP48681 1621 aa43.8■■■■■ 4.6
SIAH1-203ENST00000394725 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.74■■■■■ 4.59
SIAH1-203ENST00000394725 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.71■■■■■ 4.59
SIAH1-203ENST00000394725 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
SIAH1-203ENST00000394725 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
SIAH1-203ENST00000394725 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.67■■■■■ 4.58
SIAH1-203ENST00000394725 CUX2O14529 1486 aa43.65■■■■■ 4.58
SIAH1-203ENST00000394725 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.53■■■■■ 4.56
SIAH1-203ENST00000394725 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.51■■■■■ 4.56
SIAH1-203ENST00000394725 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.49■■■■■ 4.55
SIAH1-203ENST00000394725 IGF1RP08069 1367 aa43.49■■■■■ 4.55
SIAH1-203ENST00000394725 TOPBP1Q92547 1522 aa43.46■■■■■ 4.55
SIAH1-203ENST00000394725 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.35■■■■■ 4.53
SIAH1-203ENST00000394725 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
SIAH1-203ENST00000394725 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
SIAH1-203ENST00000394725 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.27■■■■■ 4.52
SIAH1-203ENST00000394725 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
SIAH1-203ENST00000394725 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.26■■■■■ 4.52
SIAH1-203ENST00000394725 ARAP1Q96P48 1450 aa43.25■■■■■ 4.51
SIAH1-203ENST00000394725 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.24■■■■■ 4.51
SIAH1-203ENST00000394725 APLP2Q06481 763 aa43.19■■■■■ 4.51
SIAH1-203ENST00000394725 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.09■■■■■ 4.49
SIAH1-203ENST00000394725 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
SIAH1-203ENST00000394725 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.06■■■■■ 4.48
SIAH1-203ENST00000394725 WDR97A6NE52 1622 aa42.94■■■■■ 4.46
SIAH1-203ENST00000394725 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
SIAH1-203ENST00000394725 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
SIAH1-203ENST00000394725 CUL7Q14999 1698 aa42.83■■■■■ 4.45
SIAH1-203ENST00000394725 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
SIAH1-203ENST00000394725 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.78■■■■■ 4.44
SIAH1-203ENST00000394725 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.75■■■■■ 4.43
SIAH1-203ENST00000394725 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
SIAH1-203ENST00000394725 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
SIAH1-203ENST00000394725 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.65■■■■■ 4.42
SIAH1-203ENST00000394725 P3H3Q8IVL6 736 aa42.61■■■■■ 4.41
SIAH1-203ENST00000394725 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.54■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms