RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266771.9

SLC15A4-201, Transcript of solute carrier family 15 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC15A4, Length 2,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC15A4-201ENST00000266771 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.77■■■■■ 6.52
SLC15A4-201ENST00000266771 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.62■■■■■ 5.37
SLC15A4-201ENST00000266771 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
SLC15A4-201ENST00000266771 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
SLC15A4-201ENST00000266771 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.95■■■■■ 5.11
SLC15A4-201ENST00000266771 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.88■■■■■ 5.1
SLC15A4-201ENST00000266771 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.43■■■■■ 5.02
SLC15A4-201ENST00000266771 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.38■■■■■ 5.02
SLC15A4-201ENST00000266771 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.62■■■■■ 4.89
SLC15A4-201ENST00000266771 HRCP23327 699 aa45.61■■■■■ 4.89
SLC15A4-201ENST00000266771 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.37■■■■■ 4.85
SLC15A4-201ENST00000266771 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.35■■■■■ 4.85
SLC15A4-201ENST00000266771 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
SLC15A4-201ENST00000266771 SCRIBQ14160 1630 aa44.62■■■■■ 4.73
SLC15A4-201ENST00000266771 ABCC9O60706 1549 aa44.62■■■■■ 4.73
SLC15A4-201ENST00000266771 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.71
SLC15A4-201ENST00000266771 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
SLC15A4-201ENST00000266771 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.29■■■■■ 4.68
SLC15A4-201ENST00000266771 TRIM41Q8WV44 630 aa44.24■■■■■ 4.67
SLC15A4-201ENST00000266771 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.24■■■■■ 4.67
SLC15A4-201ENST00000266771 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.15■■■■■ 4.66
SLC15A4-201ENST00000266771 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.8■■■■■ 4.6
SLC15A4-201ENST00000266771 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.58■■■■■ 4.57
SLC15A4-201ENST00000266771 WIZO95785 1651 aa43.4■■■■■ 4.54
SLC15A4-201ENST00000266771 NACADO15069 1562 aa43.36■■■■■ 4.53
SLC15A4-201ENST00000266771 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
SLC15A4-201ENST00000266771 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
SLC15A4-201ENST00000266771 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
SLC15A4-201ENST00000266771 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
SLC15A4-201ENST00000266771 ABCC8Q09428 1581 aa42.72■■■■■ 4.43
SLC15A4-201ENST00000266771 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
SLC15A4-201ENST00000266771 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.59■■■■■ 4.41
SLC15A4-201ENST00000266771 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
SLC15A4-201ENST00000266771 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
SLC15A4-201ENST00000266771 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
SLC15A4-201ENST00000266771 SOGA1O94964 1423 aa42.4■■■■■ 4.38
SLC15A4-201ENST00000266771 SMARCA4P51532 1647 aa42.39■■■■■ 4.38
SLC15A4-201ENST00000266771 SMARCA2P51531 1590 aa42.34■■■■■ 4.37
SLC15A4-201ENST00000266771 CEP162Q5TB80 1403 aa42.27■■■■■ 4.36
SLC15A4-201ENST00000266771 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.23■■■■■ 4.35
SLC15A4-201ENST00000266771 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.23■■■■■ 4.35
SLC15A4-201ENST00000266771 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.2■■■■■ 4.35
SLC15A4-201ENST00000266771 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
SLC15A4-201ENST00000266771 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.08■■■■■ 4.33
SLC15A4-201ENST00000266771 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.04■■■■■ 4.32
SLC15A4-201ENST00000266771 TNIKQ9UKE5 1360 aa42■■■■■ 4.31
SLC15A4-201ENST00000266771 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
SLC15A4-201ENST00000266771 NEUROD1Q13562 356 aa41.87■■■■■ 4.29
SLC15A4-201ENST00000266771 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
SLC15A4-201ENST00000266771 EEA1Q15075 1411 aa41.72■■■■■ 4.27
SLC15A4-201ENST00000266771 GOLGA3Q08378 1498 aa41.7■■■■■ 4.27
SLC15A4-201ENST00000266771 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
SLC15A4-201ENST00000266771 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.65■■■■■ 4.26
SLC15A4-201ENST00000266771 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
SLC15A4-201ENST00000266771 SYNJ1O43426 1573 aa41.55■■■■■ 4.24
SLC15A4-201ENST00000266771 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa41.47■■■■■ 4.23
SLC15A4-201ENST00000266771 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
SLC15A4-201ENST00000266771 CLIP1P30622 1438 aa41.39■■■■■ 4.22
SLC15A4-201ENST00000266771 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.22
SLC15A4-201ENST00000266771 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.38■■■■■ 4.21
SLC15A4-201ENST00000266771 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
SLC15A4-201ENST00000266771 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
SLC15A4-201ENST00000266771 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.3■■■■■ 4.2
SLC15A4-201ENST00000266771 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC15A4-201ENST00000266771 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC15A4-201ENST00000266771 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
SLC15A4-201ENST00000266771 KIF21BO75037 1637 aa41.22■■■■■ 4.19
SLC15A4-201ENST00000266771 APLP2Q06481 763 aa41.18■■■■■ 4.18
SLC15A4-201ENST00000266771 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.15■■■■■ 4.18
SLC15A4-201ENST00000266771 MIER1Q8N108 512 aa41.06■■■■■ 4.16
SLC15A4-201ENST00000266771 TOP2BQ02880 1626 aa40.8■■■■■ 4.12
SLC15A4-201ENST00000266771 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
SLC15A4-201ENST00000266771 ARAP1Q96P48 1450 aa40.63■■■■■ 4.09
SLC15A4-201ENST00000266771 PRXQ9BXM0 1461 aa40.57■■■■■ 4.09
SLC15A4-201ENST00000266771 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.56■■■■■ 4.08
SLC15A4-201ENST00000266771 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
SLC15A4-201ENST00000266771 ITGAEP38570 1179 aa40.5■■■■■ 4.07
SLC15A4-201ENST00000266771 CUX1P39880 1505 aa40.49■■■■■ 4.07
SLC15A4-201ENST00000266771 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.45■■■■■ 4.07
SLC15A4-201ENST00000266771 KIF27Q86VH2 1401 aa40.34■■■■■ 4.05
SLC15A4-201ENST00000266771 NCAPD3P42695 1498 aa40.24■■■■■ 4.03
SLC15A4-201ENST00000266771 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.22■■■■■ 4.03
SLC15A4-201ENST00000266771 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.18■■■■■ 4.02
SLC15A4-201ENST00000266771 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
SLC15A4-201ENST00000266771 HMGXB3Q12766 1538 aa40.16■■■■■ 4.02
SLC15A4-201ENST00000266771 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.15■■■■■ 4.02
SLC15A4-201ENST00000266771 CFTRP13569 1480 aa40.11■■■■■ 4.01
SLC15A4-201ENST00000266771 CUX2O14529 1486 aa40.03■■■■■ 4
SLC15A4-201ENST00000266771 P3H3Q8IVL6 736 aa39.96■■■■□ 3.99
SLC15A4-201ENST00000266771 IGF1RP08069 1367 aa39.96■■■■□ 3.99
SLC15A4-201ENST00000266771 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.93■■■■□ 3.98
SLC15A4-201ENST00000266771 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
SLC15A4-201ENST00000266771 KCNH8Q96L42 1107 aa39.87■■■■□ 3.97
SLC15A4-201ENST00000266771 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
SLC15A4-201ENST00000266771 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.81■■■■□ 3.96
SLC15A4-201ENST00000266771 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.77■■■■□ 3.96
SLC15A4-201ENST00000266771 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
SLC15A4-201ENST00000266771 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.75■■■■□ 3.95
SLC15A4-201ENST00000266771 TIAM1Q13009 1591 aa39.75■■■■□ 3.95
SLC15A4-201ENST00000266771 MAPKBP1O60336 1514 aa39.74■■■■□ 3.95
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