Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRTM2O43300 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRTM2O43300 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRTM2O43300 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRTM2O43300 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRTM2O43300 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms