RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381639.3

RP9P-201, Transcript of RP9 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9P, Length 1,303 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9P-201ENST00000381639 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.98■■■■■ 7.83
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RP9P-201ENST00000381639 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.91■■■■■ 6.22
RP9P-201ENST00000381639 NACADO15069 1562 aa53.8■■■■■ 6.2
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RP9P-201ENST00000381639 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.44■■■■■ 6.15
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RP9P-201ENST00000381639 SCRIBQ14160 1630 aa51.88■■■■■ 5.9
RP9P-201ENST00000381639 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.85■■■■■ 5.89
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RP9P-201ENST00000381639 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.77■■■■■ 5.72
RP9P-201ENST00000381639 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.54■■■■■ 5.68
RP9P-201ENST00000381639 SMARCA4P51532 1647 aa49.68■■■■■ 5.54
RP9P-201ENST00000381639 NCAPD3P42695 1498 aa49.67■■■■■ 5.54
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RP9P-201ENST00000381639 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.57■■■■■ 5.53
RP9P-201ENST00000381639 SMARCA2P51531 1590 aa49.5■■■■■ 5.52
RP9P-201ENST00000381639 HMGXB3Q12766 1538 aa49.34■■■■■ 5.49
RP9P-201ENST00000381639 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.3■■■■■ 5.48
RP9P-201ENST00000381639 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.23■■■■■ 5.47
RP9P-201ENST00000381639 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.11■■■■■ 5.45
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RP9P-201ENST00000381639 ERCC6Q03468 1493 aa48.44■■■■■ 5.35
RP9P-201ENST00000381639 NESP48681 1621 aa48.43■■■■■ 5.34
RP9P-201ENST00000381639 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.37■■■■■ 5.33
RP9P-201ENST00000381639 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.18■■■■■ 5.3
RP9P-201ENST00000381639 CUX2O14529 1486 aa48.18■■■■■ 5.3
RP9P-201ENST00000381639 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
RP9P-201ENST00000381639 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.09■■■■■ 5.29
RP9P-201ENST00000381639 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
RP9P-201ENST00000381639 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.81■■■■■ 5.24
RP9P-201ENST00000381639 CFTRP13569 1480 aa47.8■■■■■ 5.24
RP9P-201ENST00000381639 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.61■■■■■ 5.21
RP9P-201ENST00000381639 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.57■■■■■ 5.21
RP9P-201ENST00000381639 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.56■■■■■ 5.2
RP9P-201ENST00000381639 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.54■■■■■ 5.2
RP9P-201ENST00000381639 WDR62O43379 1518 aa47.43■■■■■ 5.18
RP9P-201ENST00000381639 PRDM2Q13029 1718 aa47.28■■■■■ 5.16
RP9P-201ENST00000381639 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.2■■■■■ 5.15
RP9P-201ENST00000381639 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
RP9P-201ENST00000381639 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
RP9P-201ENST00000381639 ABCC8Q09428 1581 aa46.84■■■■■ 5.09
RP9P-201ENST00000381639 TOPBP1Q92547 1522 aa46.75■■■■■ 5.07
RP9P-201ENST00000381639 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.66■■■■■ 5.06
RP9P-201ENST00000381639 IFT140Q96RY7 1462 aa46.61■■■■■ 5.05
RP9P-201ENST00000381639 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
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RP9P-201ENST00000381639 SOGA1O94964 1423 aa46.16■■■■■ 4.98
RP9P-201ENST00000381639 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.13■■■■■ 4.98
RP9P-201ENST00000381639 OSCARQ8IYS5 282 aa46.12■■■■■ 4.97
RP9P-201ENST00000381639 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
RP9P-201ENST00000381639 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.08■■■■■ 4.97
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RP9P-201ENST00000381639 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.82■■■■■ 4.93
RP9P-201ENST00000381639 TOP2BQ02880 1626 aa45.74■■■■■ 4.91
RP9P-201ENST00000381639 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.74■■■■■ 4.91
RP9P-201ENST00000381639 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.72■■■■■ 4.91
RP9P-201ENST00000381639 GRIN2BQ13224 1484 aa45.68■■■■■ 4.9
RP9P-201ENST00000381639 SYNJ1O43426 1573 aa45.63■■■■■ 4.9
RP9P-201ENST00000381639 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
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RP9P-201ENST00000381639 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.6■■■■■ 4.89
RP9P-201ENST00000381639 CHD1O14646 1710 aa45.56■■■■■ 4.88
RP9P-201ENST00000381639 FBLN2P98095 1184 aa45.54■■■■■ 4.88
RP9P-201ENST00000381639 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.52■■■■■ 4.88
RP9P-201ENST00000381639 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
RP9P-201ENST00000381639 SYNJ2O15056 1496 aa45.42■■■■■ 4.86
RP9P-201ENST00000381639 PBRM1Q86U86 1689 aa45.42■■■■■ 4.86
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RP9P-201ENST00000381639 ARHGEF11O15085 1522 aa45.29■■■■■ 4.84
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RP9P-201ENST00000381639 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.29■■■■■ 4.84
RP9P-201ENST00000381639 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.29■■■■■ 4.84
RP9P-201ENST00000381639 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.18■■■■■ 4.82
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RP9P-201ENST00000381639 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.89■■■■■ 4.78
RP9P-201ENST00000381639 ARAP1Q96P48 1450 aa44.88■■■■■ 4.78
RP9P-201ENST00000381639 IGF1RP08069 1367 aa44.8■■■■■ 4.76
RP9P-201ENST00000381639 CEP170Q5SW79 1584 aa44.8■■■■■ 4.76
RP9P-201ENST00000381639 CUL7Q14999 1698 aa44.64■■■■■ 4.74
RP9P-201ENST00000381639 SHROOM2Q13796 1616 aa44.58■■■■■ 4.73
RP9P-201ENST00000381639 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.51■■■■■ 4.72
RP9P-201ENST00000381639 JPH4Q96JJ6 628 aa44.48■■■■■ 4.71
RP9P-201ENST00000381639 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.44■■■■■ 4.7
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