Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMCO1Q9UM00 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO1Q9UM00 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMCO1Q9UM00 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO1Q9UM00 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO1Q9UM00 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO1Q9UM00 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO1Q9UM00 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO1Q9UM00 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO1Q9UM00 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO1Q9UM00 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO1Q9UM00 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO1Q9UM00 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO1Q9UM00 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO1Q9UM00 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms