Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms