Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CTTNBP2NLQ9P2B4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CTTNBP2NLQ9P2B4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CTTNBP2NLQ9P2B4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CTTNBP2NLQ9P2B4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CTTNBP2NLQ9P2B4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CTTNBP2NLQ9P2B4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CTTNBP2NLQ9P2B4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms