Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GALNT18Q6P9A2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GALNT18Q6P9A2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GALNT18Q6P9A2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GALNT18Q6P9A2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GALNT18Q6P9A2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms