Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC23Q53EV4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC23Q53EV4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC23Q53EV4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC23Q53EV4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC23Q53EV4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC23Q53EV4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms