Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PFKFB4Q16877 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PFKFB4Q16877 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PFKFB4Q16877 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFKFB4Q16877 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PFKFB4Q16877 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFKFB4Q16877 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFKFB4Q16877 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFKFB4Q16877 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKFB4Q16877 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKFB4Q16877 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFKFB4Q16877 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFKFB4Q16877 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFKFB4Q16877 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFKFB4Q16877 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFKFB4Q16877 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFKFB4Q16877 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms