Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2FP61218 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2FP61218 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2FP61218 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2FP61218 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2FP61218 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2FP61218 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2FP61218 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2FP61218 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2FP61218 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2FP61218 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2FP61218 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2FP61218 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2FP61218 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR2FP61218 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR2FP61218 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR2FP61218 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR2FP61218 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2FP61218 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2FP61218 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2FP61218 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2FP61218 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2FP61218 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2FP61218 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2FP61218 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2FP61218 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms