Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOSBP53539 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOSBP53539 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOSBP53539 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOSBP53539 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOSBP53539 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOSBP53539 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOSBP53539 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOSBP53539 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOSBP53539 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOSBP53539 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOSBP53539 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOSBP53539 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
FOSBP53539 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOSBP53539 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOSBP53539 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOSBP53539 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOSBP53539 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FOSBP53539 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOSBP53539 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOSBP53539 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FOSBP53539 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOSBP53539 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOSBP53539 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
FOSBP53539 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOSBP53539 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOSBP53539 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOSBP53539 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOSBP53539 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOSBP53539 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOSBP53539 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOSBP53539 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOSBP53539 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FOSBP53539 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FOSBP53539 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOSBP53539 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOSBP53539 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOSBP53539 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
FOSBP53539 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
FOSBP53539 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOSBP53539 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOSBP53539 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOSBP53539 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FOSBP53539 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOSBP53539 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOSBP53539 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOSBP53539 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOSBP53539 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOSBP53539 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOSBP53539 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOSBP53539 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
FOSBP53539 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOSBP53539 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOSBP53539 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOSBP53539 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOSBP53539 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOSBP53539 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOSBP53539 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOSBP53539 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOSBP53539 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FOSBP53539 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOSBP53539 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOSBP53539 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOSBP53539 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOSBP53539 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOSBP53539 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOSBP53539 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOSBP53539 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOSBP53539 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOSBP53539 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOSBP53539 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOSBP53539 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
FOSBP53539 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOSBP53539 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOSBP53539 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOSBP53539 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOSBP53539 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOSBP53539 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOSBP53539 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOSBP53539 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOSBP53539 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOSBP53539 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOSBP53539 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOSBP53539 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOSBP53539 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOSBP53539 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOSBP53539 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOSBP53539 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOSBP53539 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOSBP53539 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOSBP53539 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOSBP53539 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOSBP53539 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOSBP53539 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOSBP53539 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOSBP53539 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOSBP53539 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOSBP53539 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOSBP53539 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOSBP53539 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms