Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX5P35711 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX5P35711 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX5P35711 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX5P35711 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX5P35711 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX5P35711 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX5P35711 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX5P35711 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX5P35711 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX5P35711 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX5P35711 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX5P35711 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX5P35711 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX5P35711 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX5P35711 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX5P35711 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX5P35711 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX5P35711 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX5P35711 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX5P35711 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX5P35711 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX5P35711 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX5P35711 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX5P35711 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX5P35711 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX5P35711 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOX5P35711 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX5P35711 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX5P35711 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX5P35711 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX5P35711 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX5P35711 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX5P35711 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX5P35711 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX5P35711 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX5P35711 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX5P35711 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX5P35711 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX5P35711 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX5P35711 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX5P35711 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX5P35711 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX5P35711 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX5P35711 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX5P35711 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX5P35711 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX5P35711 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX5P35711 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX5P35711 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX5P35711 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX5P35711 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX5P35711 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX5P35711 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SOX5P35711 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX5P35711 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX5P35711 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX5P35711 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX5P35711 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX5P35711 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX5P35711 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX5P35711 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX5P35711 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX5P35711 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX5P35711 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX5P35711 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX5P35711 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX5P35711 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX5P35711 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX5P35711 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX5P35711 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOX5P35711 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX5P35711 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX5P35711 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX5P35711 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX5P35711 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX5P35711 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX5P35711 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX5P35711 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX5P35711 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX5P35711 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX5P35711 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX5P35711 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX5P35711 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOX5P35711 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOX5P35711 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOX5P35711 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SOX5P35711 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOX5P35711 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOX5P35711 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOX5P35711 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOX5P35711 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOX5P35711 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SOX5P35711 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX5P35711 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX5P35711 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX5P35711 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SOX5P35711 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOX5P35711 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOX5P35711 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms