Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SOX5P35711 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SOX5P35711 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SOX5P35711 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SOX5P35711 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SOX5P35711 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SOX5P35711 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SOX5P35711 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SOX5P35711 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SOX5P35711 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SOX5P35711 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOX5P35711 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOX5P35711 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SOX5P35711 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SOX5P35711 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SOX5P35711 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SOX5P35711 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SOX5P35711 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SOX5P35711 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SOX5P35711 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SOX5P35711 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SOX5P35711 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SOX5P35711 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SOX5P35711 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SOX5P35711 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SOX5P35711 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SOX5P35711 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SOX5P35711 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SOX5P35711 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SOX5P35711 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SOX5P35711 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SOX5P35711 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SOX5P35711 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SOX5P35711 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SOX5P35711 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SOX5P35711 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SOX5P35711 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SOX5P35711 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SOX5P35711 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SOX5P35711 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SOX5P35711 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SOX5P35711 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SOX5P35711 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SOX5P35711 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SOX5P35711 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SOX5P35711 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SOX5P35711 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SOX5P35711 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SOX5P35711 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SOX5P35711 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SOX5P35711 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SOX5P35711 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SOX5P35711 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SOX5P35711 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SOX5P35711 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SOX5P35711 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SOX5P35711 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SOX5P35711 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SOX5P35711 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SOX5P35711 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SOX5P35711 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SOX5P35711 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SOX5P35711 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SOX5P35711 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SOX5P35711 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SOX5P35711 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SOX5P35711 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SOX5P35711 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SOX5P35711 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SOX5P35711 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SOX5P35711 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SOX5P35711 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SOX5P35711 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SOX5P35711 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOX5P35711 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SOX5P35711 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SOX5P35711 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SOX5P35711 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SOX5P35711 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SOX5P35711 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SOX5P35711 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOX5P35711 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SOX5P35711 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SOX5P35711 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SOX5P35711 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SOX5P35711 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SOX5P35711 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SOX5P35711 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SOX5P35711 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SOX5P35711 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SOX5P35711 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SOX5P35711 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SOX5P35711 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SOX5P35711 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SOX5P35711 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SOX5P35711 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SOX5P35711 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SOX5P35711 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SOX5P35711 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SOX5P35711 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms