Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB6O14558 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB6O14558 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPB6O14558 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPB6O14558 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB6O14558 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPB6O14558 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms