Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C0C1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C0C1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C0C1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C0C1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C0C1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
H7C0C1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
H7C0C1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
H7C0C1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
H7C0C1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
H7C0C1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
H7C0C1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C0C1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C0C1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C0C1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C0C1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C0C1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C0C1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C0C1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C0C1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H7C0C1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C0C1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C0C1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C0C1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C0C1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H7C0C1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
H7C0C1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
H7C0C1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C0C1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C0C1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C0C1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C0C1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C0C1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C0C1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C0C1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C0C1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C0C1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C0C1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C0C1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C0C1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C0C1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
H7C0C1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C0C1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C0C1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C0C1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C0C1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C0C1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C0C1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C0C1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C0C1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
H7C0C1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C0C1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C0C1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C0C1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C0C1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C0C1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C0C1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C0C1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C0C1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C0C1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C0C1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C0C1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H7C0C1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C0C1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C0C1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H7C0C1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C0C1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C0C1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C0C1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C0C1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C0C1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H7C0C1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
H7C0C1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H7C0C1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C0C1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C0C1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H7C0C1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C0C1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C0C1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
H7C0C1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H7C0C1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C0C1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C0C1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C0C1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H7C0C1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C0C1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C0C1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H7C0C1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C0C1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C0C1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
H7C0C1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C0C1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C0C1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C0C1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
H7C0C1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C0C1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C0C1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C0C1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C0C1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C0C1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms