Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN3E7EW58 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRN3E7EW58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3E7EW58 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRN3E7EW58 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRN3E7EW58 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRN3E7EW58 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms