Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVD1

FAM237B, Family with sequence similarity 237 member B, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM237BA0A1B0GVD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM237BA0A1B0GVD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM237BA0A1B0GVD1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM237BA0A1B0GVD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM237BA0A1B0GVD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM237BA0A1B0GVD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM237BA0A1B0GVD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM237BA0A1B0GVD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM237BA0A1B0GVD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM237BA0A1B0GVD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM237BA0A1B0GVD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM237BA0A1B0GVD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM237BA0A1B0GVD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM237BA0A1B0GVD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM237BA0A1B0GVD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM237BA0A1B0GVD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM237BA0A1B0GVD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms