Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTL3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTL3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1B0GTL3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1B0GTL3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
A0A1B0GTL3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1B0GTL3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A1B0GTL3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
A0A1B0GTL3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1B0GTL3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1B0GTL3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1B0GTL3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1B0GTL3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms