Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHLDA3Q9Y5J5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHLDA3Q9Y5J5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHLDA3Q9Y5J5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHLDA3Q9Y5J5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHLDA3Q9Y5J5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHLDA3Q9Y5J5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms