Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMCC3Q9ULS5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCC3Q9ULS5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCC3Q9ULS5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC3Q9ULS5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC3Q9ULS5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCC3Q9ULS5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCC3Q9ULS5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCC3Q9ULS5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCC3Q9ULS5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCC3Q9ULS5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCC3Q9ULS5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCC3Q9ULS5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCC3Q9ULS5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms