Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMSAP3Q9P1Y5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMSAP3Q9P1Y5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMSAP3Q9P1Y5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMSAP3Q9P1Y5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMSAP3Q9P1Y5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMSAP3Q9P1Y5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMSAP3Q9P1Y5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMSAP3Q9P1Y5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMSAP3Q9P1Y5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMSAP3Q9P1Y5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP3Q9P1Y5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP3Q9P1Y5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP3Q9P1Y5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP3Q9P1Y5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAMSAP3Q9P1Y5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAMSAP3Q9P1Y5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP3Q9P1Y5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAMSAP3Q9P1Y5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAMSAP3Q9P1Y5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms