Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms