Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMYD2Q9NRG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMYD2Q9NRG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD2Q9NRG4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD2Q9NRG4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD2Q9NRG4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD2Q9NRG4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMYD2Q9NRG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMYD2Q9NRG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMYD2Q9NRG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD2Q9NRG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD2Q9NRG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms