Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM138Q9NPI0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM138Q9NPI0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM138Q9NPI0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM138Q9NPI0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM138Q9NPI0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM138Q9NPI0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM138Q9NPI0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM138Q9NPI0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM138Q9NPI0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM138Q9NPI0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM138Q9NPI0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM138Q9NPI0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms