Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1A7

POLR2J3, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3Q9H1A7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2J3Q9H1A7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2J3Q9H1A7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2J3Q9H1A7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2J3Q9H1A7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2J3Q9H1A7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2J3Q9H1A7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2J3Q9H1A7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2J3Q9H1A7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2J3Q9H1A7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2J3Q9H1A7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2J3Q9H1A7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2J3Q9H1A7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms