Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB17Q9H0T7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB17Q9H0T7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB17Q9H0T7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB17Q9H0T7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB17Q9H0T7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB17Q9H0T7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB17Q9H0T7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB17Q9H0T7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB17Q9H0T7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB17Q9H0T7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB17Q9H0T7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RAB17Q9H0T7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB17Q9H0T7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB17Q9H0T7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB17Q9H0T7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RAB17Q9H0T7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB17Q9H0T7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB17Q9H0T7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms