Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI7

PSD2, PH and SEC7 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD2Q9BQI7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSD2Q9BQI7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSD2Q9BQI7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSD2Q9BQI7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSD2Q9BQI7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSD2Q9BQI7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSD2Q9BQI7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD2Q9BQI7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD2Q9BQI7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSD2Q9BQI7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSD2Q9BQI7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSD2Q9BQI7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSD2Q9BQI7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSD2Q9BQI7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD2Q9BQI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms