Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3GL1Q99961 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3GL1Q99961 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3GL1Q99961 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3GL1Q99961 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL1Q99961 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL1Q99961 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GL1Q99961 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GL1Q99961 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GL1Q99961 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GL1Q99961 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GL1Q99961 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GL1Q99961 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GL1Q99961 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GL1Q99961 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GL1Q99961 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GL1Q99961 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3GL1Q99961 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms