Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRRFQ96E11 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRRFQ96E11 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRRFQ96E11 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MRRFQ96E11 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRRFQ96E11 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MRRFQ96E11 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRRFQ96E11 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRRFQ96E11 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRRFQ96E11 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRRFQ96E11 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRRFQ96E11 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRRFQ96E11 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRRFQ96E11 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRRFQ96E11 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRRFQ96E11 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRRFQ96E11 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRRFQ96E11 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRRFQ96E11 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRRFQ96E11 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRRFQ96E11 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRRFQ96E11 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MRRFQ96E11 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRRFQ96E11 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRRFQ96E11 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRRFQ96E11 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRRFQ96E11 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRRFQ96E11 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRRFQ96E11 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms