Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP3Q969Y2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTPBP3Q969Y2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTPBP3Q969Y2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTPBP3Q969Y2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTPBP3Q969Y2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTPBP3Q969Y2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTPBP3Q969Y2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTPBP3Q969Y2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP3Q969Y2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP3Q969Y2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP3Q969Y2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP3Q969Y2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTPBP3Q969Y2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTPBP3Q969Y2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP3Q969Y2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTPBP3Q969Y2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTPBP3Q969Y2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTPBP3Q969Y2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTPBP3Q969Y2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms