Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW59

SPRYD4, SPRY domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD4Q8WW59 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPRYD4Q8WW59 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD4Q8WW59 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPRYD4Q8WW59 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD4Q8WW59 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRYD4Q8WW59 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRYD4Q8WW59 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRYD4Q8WW59 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRYD4Q8WW59 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRYD4Q8WW59 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms