Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN6

SECTM1, Secreted and transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECTM1Q8WVN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SECTM1Q8WVN6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECTM1Q8WVN6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECTM1Q8WVN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECTM1Q8WVN6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SECTM1Q8WVN6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SECTM1Q8WVN6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms