Protein–RNA interactions for Protein: Q86X45

LRRC6, Protein tilB homolog, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC6Q86X45 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC6Q86X45 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC6Q86X45 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC6Q86X45 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC6Q86X45 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC6Q86X45 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC6Q86X45 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC6Q86X45 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC6Q86X45 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC6Q86X45 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC6Q86X45 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC6Q86X45 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC6Q86X45 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC6Q86X45 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC6Q86X45 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC6Q86X45 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC6Q86X45 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC6Q86X45 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC6Q86X45 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC6Q86X45 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC6Q86X45 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC6Q86X45 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC6Q86X45 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC6Q86X45 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC6Q86X45 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms