Protein–RNA interactions for Protein: Q86WR0

CCDC25, Coiled-coil domain-containing protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25Q86WR0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC25Q86WR0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC25Q86WR0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC25Q86WR0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC25Q86WR0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC25Q86WR0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC25Q86WR0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC25Q86WR0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC25Q86WR0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC25Q86WR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC25Q86WR0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC25Q86WR0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC25Q86WR0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC25Q86WR0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC25Q86WR0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC25Q86WR0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC25Q86WR0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC25Q86WR0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC25Q86WR0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC25Q86WR0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC25Q86WR0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC25Q86WR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC25Q86WR0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC25Q86WR0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC25Q86WR0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC25Q86WR0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC25Q86WR0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC25Q86WR0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC25Q86WR0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC25Q86WR0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC25Q86WR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms