Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMC3Q7Z5M5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMC3Q7Z5M5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMC3Q7Z5M5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMC3Q7Z5M5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMC3Q7Z5M5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMC3Q7Z5M5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMC3Q7Z5M5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMC3Q7Z5M5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMC3Q7Z5M5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMC3Q7Z5M5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMC3Q7Z5M5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMC3Q7Z5M5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMC3Q7Z5M5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMC3Q7Z5M5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMC3Q7Z5M5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC3Q7Z5M5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC3Q7Z5M5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC3Q7Z5M5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC3Q7Z5M5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC3Q7Z5M5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMC3Q7Z5M5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMC3Q7Z5M5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMC3Q7Z5M5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC3Q7Z5M5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMC3Q7Z5M5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC3Q7Z5M5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC3Q7Z5M5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC3Q7Z5M5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC3Q7Z5M5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMC3Q7Z5M5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC3Q7Z5M5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
TMC3Q7Z5M5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms