Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H9

FAM220A, Protein FAM220A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220AQ7Z4H9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM220AQ7Z4H9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM220AQ7Z4H9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM220AQ7Z4H9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM220AQ7Z4H9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM220AQ7Z4H9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM220AQ7Z4H9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM220AQ7Z4H9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM220AQ7Z4H9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM220AQ7Z4H9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM220AQ7Z4H9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM220AQ7Z4H9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM220AQ7Z4H9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM220AQ7Z4H9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM220AQ7Z4H9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms