Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX6Q7RTT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX6Q7RTT6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX6Q7RTT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX6Q7RTT6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX6Q7RTT6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX6Q7RTT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX6Q7RTT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX6Q7RTT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSX6Q7RTT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX6Q7RTT6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSX6Q7RTT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms