Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW05

PTCHD4, Patched domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCHD4Q6ZW05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTCHD4Q6ZW05 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCHD4Q6ZW05 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCHD4Q6ZW05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTCHD4Q6ZW05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTCHD4Q6ZW05 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTCHD4Q6ZW05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCHD4Q6ZW05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCHD4Q6ZW05 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms