Protein–RNA interactions for Protein: Q6H9L7

ISM2, Isthmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM2Q6H9L7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ISM2Q6H9L7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ISM2Q6H9L7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ISM2Q6H9L7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ISM2Q6H9L7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ISM2Q6H9L7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ISM2Q6H9L7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ISM2Q6H9L7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ISM2Q6H9L7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ISM2Q6H9L7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ISM2Q6H9L7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ISM2Q6H9L7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ISM2Q6H9L7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ISM2Q6H9L7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ISM2Q6H9L7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ISM2Q6H9L7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ISM2Q6H9L7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ISM2Q6H9L7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ISM2Q6H9L7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ISM2Q6H9L7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ISM2Q6H9L7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ISM2Q6H9L7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ISM2Q6H9L7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ISM2Q6H9L7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ISM2Q6H9L7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ISM2Q6H9L7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ISM2Q6H9L7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ISM2Q6H9L7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ISM2Q6H9L7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.9 ms