Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR38Q5JTN6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR38Q5JTN6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR38Q5JTN6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR38Q5JTN6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR38Q5JTN6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR38Q5JTN6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR38Q5JTN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR38Q5JTN6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR38Q5JTN6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR38Q5JTN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR38Q5JTN6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR38Q5JTN6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR38Q5JTN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR38Q5JTN6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR38Q5JTN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms