Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC38Q502W7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC38Q502W7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC38Q502W7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC38Q502W7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC38Q502W7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC38Q502W7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC38Q502W7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC38Q502W7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC38Q502W7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC38Q502W7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC38Q502W7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC38Q502W7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC38Q502W7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC38Q502W7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC38Q502W7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC38Q502W7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC38Q502W7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC38Q502W7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC38Q502W7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC38Q502W7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC38Q502W7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC38Q502W7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC38Q502W7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms